藏医藏药的历史可追溯到二千五百多年前的古象雄时代，古象雄本教师杰布赤协为藏医药第一创始人。藏医药学是在藏民族固有文化及传统医药的基础上吸取中医及古印度、尼泊尔、大食、克什米尔医药学理论之精华，逐渐形成的独特的民族医药学，是祖国医药学的重要组成部分。藏医学在理论上以三因素学说为理论核心，以五源学说为指导思想，以七物质、三秽物及腑脏经络的生理、病理为基础，以整体观念、辩证论治为特点，形成独特理论体系。
藏医药学是在长期与疾病斗争中形成和发展起来的。远古时期，世居在青藏高原的藏族先民在游牧和狩猎生产中不断摸索总结出用热酥油止血，酒糟热敷止痛等许多自然疗法。公元前几世纪，就懂得“有毒就有药”的道理，掌握了许多植物、动物、矿物具有治疗病痛的作用，藏族的天藏习俗给藏医们提供了绝好的解剖机会，使藏医学对人体的认识达到了前所未有的准确。公元8世纪藏医学奠基著作《四部医典》在总结藏民族自己丰富医疗经验的基础上，将古印度及阿拉伯医学的三因学说、五源学说及中医的五行学说、脉诊理论等移植到藏医学，并结合实际发展了这些理论内容。《四部医典》的问世，表明藏医学已经发展到成熟阶段，它奠定了藏医学的基础。19世纪初期，《晶珠本草》这一集藏医学大成的经典著作传世，标志着藏医药学发展到了一个新水平。